为确保新型农村合作医疗的运行安全，北川采取了“五条措施”，确保全县13万多农村人口的医疗保障。

　　一是成立了以县委常委、县纪委书记为主任的新农合监督管理委员会，负责新农合中心、各新农合服务站的监管，查处违纪违法行为；二是建立定点医疗机构评审小组。对各新农合定点医疗机构的资质、资格和执业范围进行评议和审核，以确定是否符合新农合定点医疗机构的基本要求；三是建立医疗慢性病诊断小组。对全县所有参合农民的慢性病进行诊断和确认，并出据相关证明，参合的患病农民根据诊断小组的证明到各定点医疗机构门诊就医治疗后，享受慢性病门诊补偿标准；四是建立医疗专业监督小组。对全县各定点医疗机构的诊断、检查、治疗以及用药的合理性进行监督和检查，每季度由县卫生局抽调相关人员对各定点医疗机构进行检查审核，及时发现问题整改问题；五是建立医疗专业复核小组。每月对定点医疗机构的报销比例、标准、范围以及各新农合服务站的各种票据进行复核。